Федеральное государственное бюджетное учреждение «Государственный центр агрохимической службы «Мордовский» было создано в соответствии с постановлением Совета Министров СССР от 9 апреля 1964 года № 319 «Об организации государственной агрохимической службы в сельском хозяйстве» постановлением Совета Министров Мордовской АССР от 14 августа 1964 № 514 «Об организации государственной агрохимической службы в Мордовской АССР», как Мордовская республиканская зональная агрохимическая лаборатория при Мордовской сельскохозяйственной опытной станции.

Основными целями деятельности центра агрохимической службы являются мониторинг состояния плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения на территории республики Мордовия и формирование на его основе научно-обоснованного обеспечения сохранения и повышения плодородия почв в республике для увеличения объемов производства высококачественной сельскохозяйственной продукции.

В настоящее время в практику агрохимического мониторинга внедряются современные технологии, новые системы наблюдений, сбора и обработки информации, в том числе на основе материалов дистанционного зондирования земли. Современные  GIS-технологии выводят агрохимический мониторинг на новый, качественно более высокий уровень. 

Начиная с 1996 года ФГБУ «Государственный центр агрохимической службы «Мордовский» Госстандартом России аккредитовано как технически компетентная и независимая Испытательная лаборатория по анализу сельскохозяйственной и пищевой продукции. Высокое качество анализов подтверждается в ходе межлабораторных сравнительных испытаний, ежегодно проводимых ГНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт агрохимии им. Д.Н. Прянишникова»(ГНУ ВНИИА). По данным этих испытаний наше Учреждение в рейтинге испытательных лабораторий России занимает одно из ведущих мест.